植物保护学科是甘肃省省级重点学科，现设植物病理系、昆虫学系和农药学系。有植物保护、森林保护两个本科专业，植物病理学、农业昆虫与害虫防治、农药学、作物保护4个硕士学位授权点和作物保护博士学位授权点，1个农业推广硕士专业学位（植物保护领域）授权点，基本形成了本科教育、研究生教育的多层次多规格办学格局。